Ryûko Matoi ne se sépare jamais de son ciseau géant qu’elle utilise comme une lame. Elle est d’ailleurs à la recherche de la meurtrière de son père qui possède le second ciseau. Satsuki Kiryûin, déléguée du conseil des élèves de l’Académie Honnôji, pourrait bien connaître le nom de la tueuse. Ryûko se rend donc à son école pour en savoir plus. Sur place, elle découvre que les nouveaux élèves reçoivent à leur arrivée un uniforme spécial, le « goku ». Le pouvoir que le goku confère a permis à Satsuki de prendre le contrôle de l’Académie.